INTRODUCTION |
1 |
||
|
|
|
|
I. |
UTILISATION DU TEMPS ET DE LESPACE CHEZ LES
POISSONS |
2 |
|
1.1 |
Migration et «migration»: définition et
relation |
3 |
|
1.2 |
Fitness génétique: approche
compréhensive |
4 |
|
1.3 |
Fitness: implications pour la migration |
6 |
|
1.4 |
Méthodes détude de la
migration |
7 |
|
|
Références |
8 |
|
|
|
|
|
II. |
MÉTHODES DÉTUDE DU COMPORTEMENT DES
POISSONS |
10 |
|
2.1 |
Méthodes détude indépendantes de
la capture |
10 |
|
2.1.1 |
Observation visuelle |
10 |
|
2.1.2 |
Compteur à résistivité de signaux
électriques |
10 |
|
2.1.3 |
Hydroacoustique |
11 |
|
2.2 |
Méthodes détude indépendantes de
la capture |
15 |
|
2.2.1 |
Variations de la densité et des captures par
unité deffort de pêche |
15 |
|
2.3 |
Marquage et type de marques |
17 |
|
2.3.1 |
Introduction |
17 |
|
2.3.2 |
Types de marques |
18 |
|
2.4 |
Marques biotiques extrinsèques |
19 |
|
2.4.1 |
Variables morphométriques, méristiques et truss
network |
19 |
|
2.4.2 |
Patrons de ponctuations |
20 |
|
2.4.3 |
Marques génétiques |
20 |
|
2.4.3.1 |
Polymorphisme enzymatique |
20 |
|
2.4.3.2 |
ADN mitochondrial et nucléique |
21 |
|
2.4.3.3 |
Empreintes génétiques |
21 |
|
2.4.3.4 |
Principales techniques utilisées en marquage
génétique |
22 |
|
2.4.3.5 |
Choix des marques génétiques |
26 |
|
2.5 |
Marques biologiques extrinsèques |
27 |
|
2.5.1 |
Parasites |
27 |
|
2.5.2 |
Chémométrie |
28 |
|
2.5.2.1 |
Acides gras |
28 |
|
2.5.2.2 |
Autres éléments intrinsèques |
29 |
|
2.6 |
Marques extrinsèques |
30 |
|
2.6.1 |
Marquage par mutilation |
31 |
|
2.6.2 |
Marques chimiques extrinsèques |
34 |
|
2.6.3 |
Marquage par colorants |
35 |
|
2.6.4 |
Marquages par brûlure au froid (cold branding)
|
36 |
|
2.7 |
Marques physiques («tags») |
37 |
|
2.7.1 |
Marques physiques externes |
37 |
|
2.7.1.1 |
Marques à insertion intramusculaire |
37 |
|
2.7.1.2 |
Marques transcorporelles et transstructurales |
39 |
|
2.7.2 |
Marques physiques internes |
40 |
|
2.7.2.1 |
EVI (Elastomer Visible Implant) Tag |
40 |
|
2.7.2.2 |
V.I. tags |
41 |
|
2.7.2.3 |
Micromarques magnétiques |
42 |
|
2.7.2.4 |
Transpondeurs passifs intégrés ou PIT tags
|
46 |
|
2.8 |
Marques physiques actives |
48 |
|
|
Emetteurs de biotélémétrie, marque
archives |
48 |
|
2.9 |
Choix des méthodes détude
|
48 |
|
|
Références bibliographiques |
52 |
|
|
|||
ANESTHÉSIE, MARQUAGE DES POISSONS, BIAIS LIÉS
AU MARQUAGE |
|||
|
|
|
|
III. |
ANESTHÉSIE |
58 |
|
3.1 |
Types d'anesthésiques, aspects législatifs
|
58 |
|
3.1.1 |
Anesthésiques chimiques |
58 |
|
3.1.2 |
Méthodes alternatives |
60 |
|
3.2 |
Phases de lanesthésie |
62 |
|
3.3 |
Choix dun anesthésique |
62 |
|
3.4 |
Facteurs influençant lanesthésie, le
choix des concentrations et la durée dapplication |
64 |
|
3.5 |
Perturbations de la physiologie et du comportement des
poissons par lanesthésie |
65 |
|
3.6 |
Suggestions pour lamélioration des protocoles
danesthésie et de récupération |
68 |
|
3.7 |
Fiches dutilisation des principaux
anesthésiques |
69 |
|
|
|
|
|
IV. |
FIXATION DES MARQUES TÉLÉMÉTRIQUES
|
72 |
|
4.1 |
Introduction |
72 |
|
4.2 |
Attachement externe |
73 |
|
4.3 |
Insertion intrastomacale |
74 |
|
4.4 |
Insertion intrapéritonéale |
75 |
|
4.4.1 |
Incision |
76 |
|
4.4.2 |
Positionnement de lémetteur |
77 |
|
4.4.3 |
Fermeture de lincision: suture |
78 |
|
|
Réalisation dun point de suture |
78 |
|
|
Type de point de suture |
79 |
|
|
Choix du matériel de suture |
80 |
|
4.4.4 |
Méthodes alternatives de fermeture dincision
|
81 |
|
4.4.5 |
Dynamique de cicatrisation |
83 |
|
4.4.6 |
Prophylaxie, mesures post-opératoires |
83 |
|
4.5 |
Poids, dimensions et formes des émetteurs:
limitations fonctionnelles |
85 |
|
|
|
|
|
V. |
BIAIS LIÉS AU MARQUAGE |
86 |
|
5.1 |
Survie |
86 |
|
5.2 |
Infections et blessures |
87 |
|
5.3 |
Effets sur la croissance et lalimentation
|
88 |
|
5.4 |
Effets du marquage sur le comportement et la physiologie
|
90 |
|
5.4.1 |
Flottabilité et équilibre |
90 |
|
5.4.2 |
Performances natatoire et dépenses
énergétiques |
90 |
|
5.4.3 |
Effet sur les interactions sociales |
91 |
|
5.4.4 |
Activité et sélection de lhabitat
|
91 |
|
5.4.5 |
Autres perturbations du comportement |
92 |
|
5.5 |
Rejet et perte des émetteurs |
92 |
|
5.5.1 |
Perte des marques externes |
92 |
|
5.5.2 |
Régurgitation des marques intrastomacales |
93 |
|
5.5.3 |
Expulsion de marques implantées dans la cavité
intrapéritonéale |
93 |
|
|
Mécanisme dexpulsion |
93 |
|
|
Facteurs influençant lexpulsion (Figure 5.4)
|
95 |
|
|
CONCLUSIONS |
96 |
|
|
Références |
97 |
|
|
Tracking et
biotélémétrie |
|
|
|
Propriétés des signaux, stratégies
détude, utilisation des résultats |
|
|
|
|
|
|
VI. |
PRINCIPES DE BASE, PROPAGATION DES SIGNAUX |
102 |
|
6.1 |
Spécificités et points communs de la
biotélémétrie radio et acoustique |
103 |
|
6.2 |
Propagation des signaux acoustiques (daprès
Voegeli &Pincock, 1996) |
104 |
|
6.2.1 |
Vitesse de propagation réflexion, réfraction
|
104 |
|
6.2.2 |
Pertes liées à la propagation |
105 |
|
6.2.3 |
Bruit et diminution du rapport signal/bruit |
106 |
|
6.2.4 |
Calcul de la distance maximale de détection dun
signal |
107 |
|
6.3 |
Propagation de signaux radio |
108 |
|
6.3.1 |
Atténuation des signaux radio dans leau
|
108 |
|
6.3.2 |
Atténuation dans lair et à
linterface air-eau |
109 |
|
6.3.3 |
Pertes liées à la station réceptrice
|
110 |
|
6.3.4 |
Pertes et gains liés aux antennes réceptrices et
émettrices |
110 |
|
6.3.5 |
Puissance des émetteurs, sensibilité des
récepteurs |
111 |
|
6.3.6 |
Calcul de la distance de détection dun
émetteur radio |
112 |
|
6.4 |
Choix du type de radio et de fréquence
démission en fonction de lenvironnement |
113 |
|
|
|
|
|
VII. |
POSITIONNEMENT DE LA SOURCE DÉMISSION
|
115 |
|
7.1 |
Homing in |
115 |
|
7.2 |
Positionnement à distance par triangulation
|
115 |
|
7.2.1 |
Principe de base |
115 |
|
7.2.2 |
Calcul des coordonnées cartésiennes |
116 |
|
7.2.3 |
Triangulation par stations réceptrices directionnelles
|
117 |
|
7.2.4 |
Précision du positionnement par triangulation
|
117 |
|
7.2.5 |
Diagrammes de réception et optimisation de
lutilisation des antennes directionnelles |
118 |
|
|
|
Utilisation dune antenne boucle |
119 |
|
|
Utilisation dune antenne Yagi |
119 |
7.3 |
Positionnement démetteurs mixtes par un seul
opérateur |
120 |
|
7.4 |
Positionnement à distance par navigation
hyperbolique |
121 |
|
7.5 |
Logiciel de prétraitement des données de
radiopistage «X-Y PGM track» |
|
|
7.5.1 |
Principe de fonctionnement |
121 |
|
|
|
Remarques générales |
122 |
7.5.2 |
Explication complémentaires |
122 |
|
|
|
Partie A. |
122 |
|
|
Partie B. |
122 |
|
|
Partie C. |
123 |
|
|
Partie D. |
124 |
|
|
Partie E. |
124 |
7.5.3 |
Listing du programme |
125 |
|
|
|
|
|
VIII. |
STRATÉGIE DÉTUDE |
129 |
|
8.1 |
Fréquence de récolte des données
|
129 |
|
8.1.1 |
Récolte continue |
129 |
|
8.1.2 |
Récolte périodique (échelle
journalière ou supra journalière) |
129 |
|
8.1.3 |
Récolte périodique (échelle infra
journalière) |
131 |
|
|
|
Suivi manuel |
131 |
|
|
Détection automatique |
131 |
8.2 |
Limitation technique du nombre de poissons
détectables |
132 |
|
8.3 |
Amélioration des performances de détection
|
134 |
|
8.3.1 |
Stations multi-antennes |
134 |
|
8.3.2 |
Émetteurs codés |
136 |
|
8.4 |
Recherche démetteurs, vitesse de progression
|
136 |
|
|
|
|
|
IX. |
CALCUL DU DOMAINE VITAL ET DE LAIRE
DACTIVITÉS |
138 |
|
9.1 |
Méthode du polygone convexe |
138 |
|
9.1.1 |
Principe |
138 |
|
9.1.2 |
Limitations |
138 |
|
9.2 |
Modèles statistiques normaux bivariés et
normaux circulaires |
138 |
|
9.2.1 |
Principe |
138 |
|
9.2.2 |
Limitations |
139 |
|
9.3 |
Méthode des grilles et probabilité
dutilisation de lespèce |
140 |
|
9.3.1 |
Principe |
140 |
|
9.3.2 |
Limitations |
140 |
|
9.4 |
Comparaison des différentes méthodes
|
142 |
|
9.5 |
Calcul de la surface dun polygone convexe
|
142 |
|
|
|
|
|
X. |
BIOTÉLÉMÉTRIE, MARQUES PROGRAMMABLES
ET APPLICATIONS PARTICULIÈRES |
144 |
|
10.1 |
Introduction |
144 |
|
10.2 |
Mesures de signaux de biotélémétrie
|
144 |
|
10.3 |
Inconvénients spécifiques aux
émetteurs de biotélémétrie |
147 |
|
10.4 |
Émetteurs programmables |
148 |
|
10.5 |
Exemples |
150 |
|
10.5.1 |
Application de la télémétrie en
aquaculture |
150 |
|
10.5.2 |
Fidélité au site de reproduction chez Barbus
barbus |
152 |
|
10.5.3 |
Activité et choix de lhabitat chez
languille Anguilla anguilla |
153 |
|
10.5.4 |
Utilisation du rythme cardiaque comme indicateur du
métabolisme |
155 |
|
|
|
|
|
XI. |
SYNTHÈSE, CONCLUSION, ASPECTS PRATIQUES
|
157 |
|
11.1 |
Structurer une étude ou un projet |
157 |
|
|
|
Objectif de létude |
157 |
|
|
Poissons |
157 |
|
|
Environnement |
157 |
|
|
Calcul du coût total de létude,
détermination de la faisabilité budgétaire |
157 |
11.2 |
Information, récompense |
158 |
|
11.3 |
Risques inhérents aux méthodes de
biotélémétrie |
158 |
|
|
Références |
159 |