Investigaciones recientes sugieren que hay una necesidad urgente de crear transiciones hacia la agroecología para abordar los numerosos problemas ecológicos, sociales y éticos causados por el Régimen Alimentario Corporativo hegemónico. Sin embargo, en el Sur Global ya existen numerosas y diversas iniciativas agroecológicas impulsadas por comunidades campesinas, pueblos indígenas y organizaciones de base. Aunque se han identificado muchas innovaciones agroecológicas desarrolladas por estos grupos de base, rara vez se han analizado bajo un marco teórico específico de la innovación (por ejemplo, la innovación de base). Para contribuir a este vacío, este artículo revisa la literatura existente sobre agroecología que se ocupa de la innovación. Además, analiza tres estudios de caso en Michoacán (México) utilizando dos marcos teóricos: la innovación de base y las transiciones hacia la sostenibilidad. Los casos ilustran diferentes visiones y formas de practicar la agroecología, así como el desarrollo de varias innovaciones agroecológicas. El estudio aporta pruebas empíricas sobre el potencial de los grupos de base del Sur Global para crear innovaciones que pueden ser útiles en la transición hacia un régimen alimentario más justo y sostenible basado en la agroecología. Estas pruebas tienen importantes implicaciones para la elaboración de políticas en materia de agricultura, cambio climático y conservación biocultural.