Des recherches récentes suggèrent qu'il est urgent de créer des transitions vers l'agroécologie afin de résoudre les nombreux problèmes écologiques, sociaux et éthiques causés par le régime alimentaire hégémonique des entreprises. Dans le Sud, cependant, il existe déjà de nombreuses et diverses initiatives agroécologiques menées par des communautés paysannes, des peuples autochtones et des organisations de base. Bien que de nombreuses innovations agroécologiques développées par ces groupes de base aient été identifiées, elles ont rarement été analysées dans un cadre théorique spécifique de l'innovation (par exemple, l'innovation de base). Pour combler cette lacune, cet article analyse la littérature existante sur l'agroécologie qui s'intéresse à l'innovation. En outre, il examine trois études de cas dans le Michoacán (Mexique) en utilisant deux cadres théoriques: l'innovation à la base et les transitions vers la durabilité. Les cas illustrent différentes visions et manières de pratiquer l'agroécologie, ainsi que le développement de plusieurs innovations agroécologiques. L'étude fournit des preuves empiriques sur le potentiel des groupes de base dans le Sud pour créer des innovations qui peuvent être utiles dans la transition vers un régime alimentaire plus juste et durable basé sur l'agroécologie. Ces preuves ont des implications importantes pour l'élaboration de politiques en matière d'agriculture, de changement climatique et de conservation bioculturelle.