El Comité Nacional del Codex Alimentarius, Capítulo Paraguay (CONACAP), es el organismo encargado de la formulación de la posición país ante la Comisión mixta FAO/OMS, su Comité Ejecutivo y sus Órganos Auxiliares. Los Subcomités Técnicos (SCT) son conformados por grupos de expertos técnicos de las distintas instituciones que participan regularmente de las actividades del Codex a nivel país. El Coordinador de cada SCT es responsable de convocar reuniones con expertos relevantes en el tema de estudio, para evaluar la información, revisar las normas y recabar los aportes de cada sector en relación a los temas de consulta. El SCT tiene la responsabilidad de desarrollar propuestas basadas en los estándares y la experiencia nacional, para luego enviar la información al CONACAP a través de la Secretaría Ejecutiva, vigilando el proceso de aprobación de la posición país. La Secretaría Ejecutiva del CONACAP remite la posición país respaldada al Punto de Contacto del Codex en Paraguay, quien reenvía al Comité del Codex correspondiente. Las instituciones que regularmente participan de las consultas son del sector público y privado, la academia, los consumidores y los municipios. Se incluyen en estas participaciones a los Ministerios de Salud Pública y Bienestar Social a través del Instituto Nacional de Alimentación y Nutrición, Industria y Comercio, Agricultura y Ganadería, Relaciones Exteriores; el Instituto Nacional de Tecnología, Normalización y Metrología, la Municipalidad de Asunción, el Servicio Calidad y Salud Animal, el Servicio Nacional de Sanidad y Calidad Vegetal y de Semillas, la Universidad Nacional de Asunción, la Federación de la Producción, la Industria y el Comercio, la Unión Industrial Paraguaya y la Asociación Rural del Paraguay.