Le Ministère de l'agriculture et de l'élevage a confirmé que la distribution de fongicides à 17.000 producteurs de café commencera le 21 Juin 2014, dans le but de lutter la rouille provoquée par des champignons s’attaquant aux plantations à l'échelle nationale. 14 points de distribution ont été créés à travers le pays, les distributions devant commencer dans la région de la Cordillera del Balsamo et la région du volcan San Salvador. Les niveaux de rouille dans le pays s'élèvent actuellement à 5-6% et, en raison du climat, les régions à plus haute altitude connaissent des niveaux plus élevés de rouille . Les fongicides ont été acquis par le biais de Bolpros, Bolsa de productos y servicios. Certains producteurs de café ont choisi de cultiver le cacao à la place, en raison de l'impact de la rouille, car le cacao n'est pas affecté par ce fléau.