粮食和农业植物遗传资源国际条约

常见问答——全球信息系统门户和数字对象标识符

全球信息系统总体情况

全球信息系统总体情况

什么是全球信息系统?

全球信息系统是《国际条约》第17条所指的粮农遗传资源全球信息系统。该系统建立在现有信息系统基础上,实现各系统互联,促进粮农植物遗传资源相关科学、技术和环境事项的信息交流。2015年,《国际条约》管理机构通过了开发全球信息系统的《愿景》和《工作计划》。全球信息系统包括基于网络的门户网站。

您可以点击此处了解更多。

全球信息系统如何启动?

在德国政府支持下,《工作计划》实施着手于建立信息技术基础设施(如全球信息系统门户网站),制定粮农植物遗传资源特性鉴定和记录标准。工作计划实施还促进推广系统互操作工具,在部分发展中国家举行研讨会,开展能力建设活动。

何方为全球信息系统开发提供指导和建议?

《国际条约》管理机构提供指导,科学咨询委员会则向秘书处提供全球信息系统实施建议。此外,为满足全球粮农植物遗传资源界的需求,还向各类利益相关方征求意见。

全球信息系统门户网站

全球信息系统门户网站

什么是全球信息系统门户网站?

它是基于网络的全球门户,供用户和第三方系统获取科学、技术和环境事项相关信息和知识,加强粮农植物遗传资源保护、管理和利用活动。门户网站还促进粮农植物遗传资源接受方根据《国际条约》和《标准材料转让协定》规定,提供所有非保密信息及其种质研发成果。粮农组织于2017年10月推出全球信息系统门户网站,并于2021年2月进行重大更新。

全球信息系统记录哪些类型的粮农植物遗传资源?

全球信息系统可纳入各类粮农植物遗传资源,包括基因库样本、育种品系、正在培育的粮农植物遗传资源、已发布品种、农民持有的材料、社区种子库或非正式工作或研究收藏材料,以及所有其他研究材料,如绘图种群、纯化遗传种群等。

全球信息系统为现有系统带来哪些附加价值?

全球信息系统链接至现有系统中已有的基因库样本和农场或自然环境中维护品种的育种和研究信息,为这些系统增加价值。全球信息系统惠及研究机构、国家目录、植物标本馆和私营部门,提供条理清晰的网站链接集,在这些网站上提供并更新信息。粮农组织与《国际条约》秘书处正在研究最佳技术方案,促进用户和第三方信息系统在多个数据源搜索,并在现有系统和数据库中开发数据可视化工具。

数字对象标识符——标准的概念和益处

数字对象标识符——标准的概念和益处

全球信息系统倡导哪些标准?

全球信息系统提倡使用数字对象标识符,作为唯一且永久标识粮农植物遗传资源并促进交互操作的通用标准。

全球信息系统描述符《全球信息系统数字对象标识符分配的必要数据》)第二版于2017年发布,同时发布的还有适用于种质样本的第一版。数字对象标识符最佳使用准则等文件作为参考指南,可根据用户需求持续制定,进一步充实和完善。最新版本可在线获取。

数字对象标识符与现有标识符有何关系?

数字对象标识符旨在与其他标识符共存。数据管理者可保留目前的样本标识符继续使用,并用作全球信息系统的搜索关键词。这最大限度减少采用数字对象标识符对现有系统和既定程序的影响。对于超出现有标识符预期范围的所有用途,例如在不同信息系统和不同社区之间信息共享,建议使用数字对象标识符。

数字对象标识符与现有标识符相比有哪些新增功能?

数字对象标识符: 

  • 能够为跨系统数据整合开发其他功能;
  • 与为特定群体(如基因库和育种者)设计的现有标识不同,能够为识别粮农遗传资源种类提供单一标准。

收集材料标识符是否会被数字对象标识符取代?

数字对象标识符并非用于取代广泛用于基因库的收集材料标识符,也非用于取代您所在组织目前使用的任何其他标识符。您可继续使用最熟悉的标识符。但当材料转让到您所在机构之外时,使用数字对象标识符能够确保材料正确标记,并享受全球信息系统和数字对象标识符的惠益。

使用数字对象标识符是否有助于遵守《条约》规定的信息共享条款?

是的。这有助于材料提供方履行《国际条约》规定的义务,提供粮农植物遗传资源的所有非保密信息。还便于《标准材料转让协定》下的材料接受者履行义务,提供所接受材料的所有非保密研发信息。在通过Easy-SMTA系统报告根据《标准材料转让协定》进行的转让时,可以使用数字对象标识符。

为植物材料分配数字对象标识符是否有助于界定《标准材料转让协定》中的特许费?

数字对象标识符本身对特许费无任何直接影响。

数字对象标识符是否会作为报告要求添加到Easy-SMTA系统中?

在《标准材料转让协定》报告中不强制使用数字对象标识符。但可在《标准材料转让协定》附件1(即《标准材料转让协定》提供的转让材料清单)样本ID字段中自愿使用数字对象标识符识别转让材料。

是否需要为管理的粮农植物遗传资源获取数字对象标识符?

不,没有义务获取数字对象标识符:使用该系统完全出于自愿。但获取数字对象标识符方便您使用全球信息系统提供的新功能,因此若您需要任何此类功能,需获取数字对象标识符。

中心用户是否必须为内部用途分发的材料使用数字对象标识符?

否。但中心可以选择自主制定强制性标准运作程序。

是否已制定协议促进在全球种质资源研究信息网络(GRIN-Global)中分配数字对象标识符?

秘书处正在与美国农业部、国际玉米小麦改良中心以及全球种质资源研究信息网络的其他用户合作,确保全球种质资源研究信息网络未来版本与全球信息系统能够交互操作,获取数字对象标识符。

如何将植物材料第一/真正提供方“农民”纳入考虑?

农民受邀自主或通过协会或其他协调形式加入全球信息系统倡议。我们正在分析农民需求,以及其他用户群体需求,促进全球信息系统尽可能切实有效。

您认为动员农民与出版物和机构联系是宣传其保护粮农植物遗传资源努力的有利方式吗?

是的。正如其他全球信息系统用户,农民可以加入全球信息系统计划,并为自身材料分配数字对象标识符。从发展中国家偏远农村地区加入全球信息系统可能存在技术问题,但在此情况下,农民协会或其他协调机构可以充当代理人。

为何选择数字对象标识符作为全球信息系统标识符?

数字对象标识符被视为最有效的永久唯一标识符技术,用于在《国际条约》及其多边系统的范围内外明确且永久地识别正在交换的粮农植物遗传资源。一旦分配数字对象标识符,粮农植物遗传资源样本和相关信息就可在各组织间方便、明确且永久引用。

有了数字对象标识符,由不同组织和多个数据库提供的粮农遗传资源相关非保密信息可以更有效收集和利用。分配数字对象标识符是第一个关键步骤,可以在全球范围内获得更有条理、更可管理、更有效且更可用的粮农植物遗传资源信息,支持植物育种、研究和培训。

数字对象标识符使用主要具备哪些预期优势?

采用数字对象标识符预计会给粮农植物遗传资源用户带来若干重大惠益:

  • 更易于发现和获取粮农植物遗传资源材料相关信息;
  • 通过自动化手段更有效收集此类信息;
  • 更准确识别材料、相关信息以及相关权利和义务;
  • 研究成果与材料之间建立更可靠联系;
  • 获得先进服务,例如标识已引用具体材料的出版物。

 

用于识别作物品种的数字对象标识符和指纹有何区别?

两者完全不同。数字对象标识符是数字标识符,正如护照号码或社会安全身份信息,而DNA“指纹”则是生物体基因组成特征部分的记录。验证数字对象标识符需交叉引用相关元数据,而验证DNA指纹需重新提取和重新分析DNA样本。

是否有任何可行性或试点研究评估数字对象标识符在基因库使用情况?

《国际条约》秘书处与伙伴机构合作,目前正在实施若干试点项目,促进数字对象标识符实际应用。一个实例是印度尼西亚主导的项目,该项目正在验证区域层面全球信息网络基础设施和流程。此外,《国际条约》正通过各类国家和国际基因库以及研究界促进数字对象标识符应用。仅在行动第一个月,全球信息系统就已为超过56万份基因库收集材料分配数字对象标识符。

使用数字对象标识符有何成本?

《国际条约》秘书处为整个粮农植物遗传资源界免费提供数字对象标识符注册。

数字对象标识符实际应用

数字对象标识符实际应用

如何将我的系统链接至全球信息系统?

您可以联系《国际条约》秘书处([email protected]),说明想登记的材料和您所在组织主要数据管理员的详细联络方式。

数字对象标识符格式?含几位数字?是否适用于标签和运输清单?

全球信息系统数字对象标识符示例:10.18730/12A2E。即使有10亿个数字对象标识符,实际字符串依然类似于10.18730/3D2ZQ6,相当紧凑。

能否在数字对象标识符中直观显示某种“含义”(人类可理解且可阅读)?

全球信息系统分配的数字对象标识符完全不透明:仅看数字对象标识符无法提取任何含义。解析数字对象标识符(即输入到全球信息系统搜索功能或任何其他数字对象标识符解析服务),能够正确获取数字对象标识符相关粮农植物遗传资源信息。

数字对象标识符是网址吗,链接至何页面?

数字对象标识符本身不是网址。但可以很容易通过使用相关表格转换为网址:https://doi.org/(如:https://doi.org/10.1109/5.771073)。转换为网址时,数字对象标识符链接至数字对象标识符注册系统提供的登陆页面。对于全球信息系统数字对象标识符,则链接至全球信息系统粮农遗传资源相关信息页面,以及资源所有者网站(若提供)。

如何识别材料?

用户可以根据所在群体注册常用的标识符,如收集材料ID、选择ID、选择编号、衍生物名称、种群ID、种子批号ID、目录条目等,甚至是采集者在原生境条件下采集样本时创建的样本ID加以识别。

如何在全球信息系统门户网站上注册粮农植物遗传资源?

在全球信息系统注册粮农植物遗传资源可采用三种方案。第一种,对于少量记录,使用门户网站提供的网络表格。第二种是根据我们的规范汇编批处理文件(基本是Excel文件)。然而,由于容易出错而且费时,这个方案应视为权宜之计。推荐方法是采用已发布的XML整合协议,确保更加有效且可靠地与全球信息系统框架整合。我们欢迎您自行创建协议实施方案,但秘书处也免费提供易于使用的工具包,提供在全球信息系统注册材料所需的所有功能。请与《国际条约》秘书处联系([email protected]),了解更多信息。

获取植物材料数字对象标识符需多长时间?

获得全球信息系统访问权后,注册数字对象标识符只需填写一份网络表单,并按“提交”按钮。数字对象标识符分配即时进行,新分配的数字对象标识符可以立即在出版物中使用。对于通过XML协议获取数字对象标识符,成功获得响应后,所含的数字对象标识符即可使用。对于批量注册,《国际条约》秘书处反馈的文件包含数字对象标识符,可立即使用。

注册过程似乎取决于收集材料规模。您如何定义规模?

XML协议建议用于任何规模的收集材料。但可在三个方案中任选一个进行注册:使用网络表单手动进行,使用批处理文件或XML协议。还提供集成工具包,方便安装XML协议。选择哪个方案由用户决定。我们推荐小型收集材料使用网络表单,个人可在几小时或几天内完成手工注册(200个以内的收集材料属于小型规模)。当收集材料数量达到约1 000个时,手工逐一注册费时费力。在此情况下,批量注册更合适。对于数量较多的收集材料,XML协议是首选方案,因为最大程度减少人工干预。

粮农组织是否会在数字对象标识符和永久标识符之间建立联系?

用户有意通过全球信息系统注册数字对象标识符,需从Easy-SMTA系统获得永久标识符,维护账户信息。Easy-SMTA系统为全球信息系统提供用户管理服务。

注册过程中是否提供任何支持?

秘书处将为开发和测试您的系统与全球信息系统之间的集成层提供支持。为进一步促进XML协议应用,我们免费提供易于部署和配置的工具包,不仅提供全球信息系统整合服务,还酌情提供《标准材料转让协定》报告工作流程。

国家层面存在许多收集材料持有者。哪些机构有资格分配数字对象标识符或如何安排数字对象标识符?

每个持有人均应独立注册数字对象标识符。如需集中协调,协调机构可代表各持有人注册数字对象标识符。为支持此类情况,全球信息系统允许代理注册。

数字对象标识符与种质样本相关还是与其描述相关?

全球信息系统中的数字对象标识符与种质样本相关,即持有个人或机构,而非与其描述相关。

各中心能否独立于全球信息系统提供的机制,自行分配数字对象标识符?

可以。然而,各中心在决定是否自行分配数字对象标识符之前应考虑后果。首先,为参与全球信息系统并获得相关惠益,粮农植物遗传资源仍需在全球信息系统注册。如果该中心自行提供数字对象标识符,全球信息系统不再分配新的数字对象标识符。其次,自主分配数字对象标识符意味着注册者遵守数字对象标识符系统规定的义务,例如提供登陆页,并承诺永久维护该登陆页。第三,使用全球信息系统以外的系统注册数字对象标识符需将粮农植物遗传资源描述符映射到数字对象标识符元数据结构。第四,《国际条约》为在全球信息系统注册的材料免费提供数字对象标识符,而使用其他服务注册数字对象标识符通常产生一些费用。

数字对象标识符可用于历史样本吗?

可以,数字对象标识符通常分配给现有材料。如果材料随后丢失或无法复制或转让,数字对象标识符继续存在,因为其他数字对象标识符、出版物或数据集可能引用该材料。因此,开发具体的数字对象标识符描述符,表明该样本不复存在。

也可为历史材料分配数字对象标识符,甚至在注册时也可以。如果历史材料信息与现存材料相关,建议采取这种做法。例如,假设基因库或收集者将同一材料副本提交两个不同基因库,随后又丢失原始材料。通过给原始材料分配数字对象标识符,两个接收基因库都可为收集材料的祖先亲本指定相同的原始数字对象标识符,清楚记录两个收集材料之间的关联。

数字对象标识符是否囊括遗传变异性?

是的,如果材料遗传成分发生变化,持有人可申请新的数字对象标识符。数字对象标识符提供了更多灵活性,因为考虑到生成材料的基本方法,更适用于基因库以外的情况。

如果后来发现数字对象标识符申请时提供的部分信息有误或不完整,会发生什么情况?

可由数据管理者以类似现有标识符的方式适当修改,例如持有机构分类、名称或代码变化。这是因为数字对象标识符与实际材料相关,而非与描述符集相关。

如何防止数字对象标识符转录错误?

每个数字对象标识符都包含一个“校验和”。如果您在输入数字对象标识符时出现转录错误,数字对象标识符无效。您可以在全球信息系统服务器上检查数字对象标识符是否有效。

此外,最佳做法是尽可能避免手动输入或书写数字对象标识符,而以电子方式阅读和书写,例如扫描数字对象标识符条形码。

当然,这并不能防止所有错误,因此,仍需核实各粮农植物遗传资源是否正确使用数字对象标识符。

数字对象标识符是否可能重复?

不可能创建两个相同的数字对象标识符。数字对象标识符由全球信息系统分配,并确保唯一性。当全球信息系统将数字对象标识符注册到DataCite时,会进一步进行唯一性检查,数字对象标识符之后传输到全球数字对象标识符系统时,也会再次检查。

如果样本分配了数字对象标识符,但后来发现是内部重复的样本,可以忽略这个新的数字对象标识符吗?

是的,可以忽略这个新的数字对象标识符。为帮助确保其不被使用,并防止汇总基因库相关统计数据时误用,最好标记为历史记录。

接受方是否应记录并使用提供方的数字对象标识符?

《数字对象标识符作为粮食和农业植物遗传资源永久唯一标识符的最佳使用准则》为接受方应在哪些情况下使用提供方的数字对象标识符或获取新的数字对象标识符提供了指导。

为何我们允许材料接受方不提供来自提供方的数字对象标识符,从而防止收集材料被追踪?

《国际条约》第12.3条(b)款规定的条件(“应迅速提供获取机会,无需追踪单份收集材料”)解释为,不强制要求将接受方的数字对象标识符与提供方的标识符相关联。《国际条约》管理机构可选择重新审议此事。目前,如《准则》所述,我们只能鼓励所有用户为其收到的粮农植物遗传资源获取新的数字对象标识符,并将这些数字对象标识符与提供方的数字对象标识符适当关联。维护这些关联性益处颇多,应当足以鼓励大多数接受方适当将数字对象标识符相关联。

何时应为收集材料初次分配数字对象标识符?

一旦基因库管理人员希望公开其存在,就应为收集材料分配数字对象标识符。《数字对象标识符最佳使用准则》作为规范粮农植物遗传资源永久唯一标识符的准则,进一步提供了信息。

能否为纯系收集材料分配数字对象标识符,以供他人获取?

可以。

基因库大多数收集材料具有遗传异质性,并随时间变化。这对数字对象标识符管理有哪些影响?

收集材料遗传变异性是基因库管理者做出基因库管理决定的主要因素。解决这一问题的措施记录于《粮食和农业植物遗传资源基因库标准》。基因库管理人员通常会保持收集材料ID不变,但如果观察到遗传变化过大,考虑到材料育种系统,将分配新的收集材料ID。在某些情况下(例如DNA测序和基因发现),需更加严格,例如纯化收集材料以减少其遗传变异性,为纯化样本分配新的收集材料ID,对收集材料遗传组成进行更严格检查,或对其组成部分使用更具体标识。同样原则也适用于数字对象标识符:管理者仅在出现明显遗传变化时分配新的数字对象标识符,也可采用需更频繁分配新数字对象标识符的更严格标准,或者对收集材料组成部分采用数字对象标识符。

能否将数字对象标识符分配给育种计划的中间材料?

可以,可为育种计划中间材料分配数字对象标识符,但不强制分配,而且往往可能不合适。

经验之法是,数字对象标识符分配给持有人希望公开存在的任何材料;育种材料也不例外。仅一小部分育种材料在育种者组织之外共享,绝大部分则被销毁。因此,建议只在育种材料或相关信息在育种者组织之外共享时才分配数字对象标识符。分配数字对象标识符的材料的来源细节仍将在育种管理系统中提供,并可向公众提供与数字对象标识符相关的适当链接。

如果收集材料部分取样,是否需要分配新的数字对象标识符?

无需分配新的数字对象标识符,但可酌情分配。

如果子样本与父本具有相同的遗传实体,则可对子样本使用相同的数字对象标识符。另外,由于数字对象标识符可以按注册人认为适当的任何期望的精确程度和粒度分配,如果基因库管理者有理由公开作为独立实体存在的特定子样本,就会分配新的数字对象标识符。必须说明子样本来自该收集材料,并提供子样本父本收集材料的数字对象标识符。

另一方面,如果子样本出于不同目的,例如,如果包含混合收集材料的特定成分,原始数字对象标识符则不用于子样本:如有需要,应获取新的数字对象标识符。同样必须提供子样本父本收集材料的数字对象标识符,说明子样本是从该收集材料中提取的。

数字对象标识符何时变化?

根据定义,数字对象标识符永远不变。

对于基因库管理人员而言,是否提供任何指导用于将多作物基础性状数据与全球信息系统核心描述符相映射?

2017年,秘书处为基因库开发了首个用例。利用一张表格将全球信息系统核心描述符与相应MCPD 2.1描述符相映射,作为全球信息系统描述符附件。

为何不强制要求提供原产国?

原产国不强制提供,因为较早的材料原产国往往不明,而且单一原产国的概念本身往往不适用于现代育种材料和已发布品种。将现代品种谱系追溯到从农民处收集的品种,可能发现它们的祖先亲本分布于20个或更多的国家,而正在进行的杂交、测试和选育过程往往在多国进行。在这些情况下,“原产国”没有任何意义。

如果数字对象标识符按持有人以及基因身份识别每个样本,如何处理广大农民种植的品种?

栽培品种的处理方式与其他所有各类粮农植物遗传资源相同。农民可以为其维护的栽培品种获取数字对象标识符。种子公司可为其出于商业销售目的维护的栽培品种获取数字对象标识符。负责测试和发布新栽培品种的国家管理机构可为其测试、维护或发布的材料获取数字对象标识符。

我们如何鼓励基因库材料接受方继续使用已分配的数字对象标识符?

如果您是基因库管理人员,可以向接受方使用宣传数字对象标识符的益处,从而促进数字对象标识符使用。益处包括:使用数字对象标识符促进方便获取相关材料的所有最新在线信息;如果接受方在出版物和在线数据集中使用数字对象标识符,自动遵守《标准材料转让协定》第6.9条规定的义务。您可告知接受方可以使用提供方的数字对象标识符,但建议为收集材料副本获取新的数字对象标识符,并将其与提供方的数字对象标识符相关联,指定提供方数字对象标识符作为新数字对象标识符的前身。帮助接受方一并列出数字对象标识符和收集材料ID,并提供电子版或条形码数字对象标识符,无需手动输入。

我们是否应建议将数字对象标识符作为识别出版物中材料的主要手段?

是的,出版商日益要求对粮农植物遗传资源进行精准唯一识别,数字对象标识符有助于实现这一目标。建议在出版物元数据中引用材料的数字对象标识符,促进数字对象标识符系统提供高级服务。案文中建议,用法参照缩略语(第一次使用时同时指明数字对象标识符和更易理解的名称,此后仅使用可理解名称),或参照出版物中的数字对象标识符(案文中仅使用可理解ID,并在文末提供相关数字对象标识符列表)。

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