Los ingredientes secos deben mantenerse secos y frescos y usarlos según el principio de que el primero en entrar es el primero en salir. Como regla general, el porcentaje de humedad tendría que ser menor al 13 por ciento, en particular en áreas húmedas y/o tropicales (Cruz, 1996; Parr, 1988).
Los tanques donde normalmente se almacenan estos ingredientes deben limpiarse mensualmente o con la frecuencia que indique la experiencia, para prevenir la acumulación de polvo o residuos de alimentos. Esta acumulación crea un hábitat adecuado para mohos (con la posible producción de micotoxinas) e insectos que pueden destruir rápidamente el valor nutritivo de los productos almacenados; el calor producido por estos organismos también puede generar una combustión espontánea que redunde en graves pérdidas de los ingredientes y posiblemente también de la propiedad. Por las mismas razones, también deben inspeccionarse y limpiarse periódicamente la base del montacargas y las demás maquinarias de transporte, así como las tuberías.
Aunque la elaboración ulterior podría diluir o eliminar las concentraciones de moho e insectos, mantener los equipos y los almacenes libres de polvo y de alimentos viejos previene o al menos reduce la posibilidad de contaminación de los alimentos terminados.
Los ingredientes líquidos como sebo, aminoácidos y melazas deben almacenarse de acuerdo con los procedimientos recomendados por el fabricante para proteger su frescura.
Es posible que las grasas y aceites necesiten ser calentadas para mejorar su manejo y/o añadirles antioxidantes (de modo de prevenir la perioxidación de los lípidos y controlar los sabores no consentidos de los alimentos), con el fin de conservar la calidad (Hardy y Roley, 2000).
En general, los alimentos para la acuicultura están compuestos por algunos ingredientes altamente degradables y a menudo muy caros; por lo tanto hay que tener mucho cuidado de conservar tanto estos ingredientes como el alimento elaborado lejos de contaminantes como luz y calor y también lejos de factores biológicos como moho, insectos, aves y roedores (Cruz, 1996; OKeefe, 2000).
El ácido propiónico y otros agentes antihongos pueden utilizarse durante la elaboración, pero estos elementos químicos pueden afectar negativamente el sabor y la eficacia del alimento. Tanto el productor de alimentos como el acuicultor -como usuario final de aquellos- deben recordar que el calor, la luz y la humedad pueden estropear los alimentos. Los sacos que los contienen deben almacenarse a distancia del suelo, sobre bandejas de carga, y no estar expuestos a la luz directa del sol debido a los efectos nocivos de los rayos ultravioletas (New, Tacon y Csavas, 1995).
Según el origen y la naturaleza del alimento a granel, puede ser necesario limpiar los ingredientes. La mayoría de las fábricas de alimentos acuícolas posee sistemas de limpieza del grano diseñados para eliminar las semillas rotas, detritos de metal y otros materiales extraños que contaminan ocasionalmente los ingredientes almacenados.
La especificación de que el polvo y otros contaminantes no excederán cierto nivel resulta útil para el cliente. Los ingredientes entrantes podrán ser rechazados si sus niveles de contaminación exceden los valores especificados.
Los animales acuáticos son particularmente sensibles aun a niveles bajos de, por ejemplo, fumigantes, y posiblemente micotoxinas; por esta razón, se debe tener mucho cuidado en la elección, origen y manejo de los ingredientes de alimentos para la acuicultura (Cruz, 1996).
Los bidones, silos, almacenes y el sistema de manipulación de los ingredientes en general deben ser diseñados de manera que la humedad, los roedores, las aves y otras plagas no tengan acceso a él. La limpieza regular de los equipos de almacenamiento ayudará a alcanzar un producto final de alta calidad.
Uno de los factores más influyentes en las etapas de recepción y almacenamiento es la correcta programación del arribo de los ingredientes, con el fin de minimizar el tiempo de almacenamiento y la manipulación. Una excesiva manipulación puede disminuir el valor nutritivo o la eficacia, ya se trate de suplementos y/o medicamentos ensacados, o de maíz a granel o harina de soja, por ejemplo, merma de calidad que también favorece pérdidas económicas.
El alimento mal formulado, dañado o devuelto debe ser almacenado de manera tal que no pueda contaminar otros alimentos y será necesario analizarlo para determinar si puede ser reprocesado o, por el contrario, debe ser destruido. En este caso se pone nuevamente de manifiesto la importancia de la documentación que permita el rastreo, especialmente si se trata de alimentos tratados con drogas medicinales.