Los otolitos generalmente se preservan secos en sobres de papel, lo cual facilita su manipulación en trabajos de campo, así como su archivo dado el reducido espacio que ocupan.
En algunas especies es importante mantener la condición de fresco de los otolitos, ya que cuando se archivan secos éstos se vuelven extremadamente opacos, dificultando su lectura. A tales efectos, los otolitos deben preservarse en una solución de glicerina (75%) y agua (25%) a la que se le agrega unos cristales de Timol, éste último para evitar el crecimiento de bacterias y hongos.
