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11 juillet 2024, 08:30 heures; Rome
Situation: Virus influenza aviaire hautement pathogènes (sous-types H5, H5N1, H5N2, H5N6, H5N8, H7 et H7N6) à potentiel pandémie dans les pays d’Afrique subsaharienne depuis février 2017.
Pays confirmés (H5): Afrique du Sud*.
Pays confirmés (H5N1): Afrique du Sud, Benin, Botswana, Burkina Faso*, Cameroun, Côte d’Ivoire, Réunion (France), Gabon, Gambie Ghana, Guinée, Lesotho, Mali, Mauritanie, Namibie, Niger*, Nigéria*, Sénégal, Afrique du Sud et Togo.
Pays confirmés (H5N2): Nigéria et Afrique du Sud.
Pays confirmés (H5N6): Nigéria.
Pays confirmés (H5N8): Cameroun, République démocratique du Congo, Namibie, Niger, Nigéria, Afrique du Sud, Ouganda, et Zimbabwe.
Pays confirmés (H7): Afrique du Sud.
Pays confirmés (H7N6): Afrique du Sud* et Mozambique*.
Constatations animales: 2 nouveaux évènements depuis la dernière mise à jour du 13 juin 2024.
Nombre de cas humains: 0 évènements depuis la dernière mise à jour (dernière évènement déclaré 10 novembre 2021).
* Pays ayant rapporté des cas d’IAHP durant cette vague (depuis le 1er octobre 2023)
Carte. Foyers d’IAHP officiellement déclarés (sous-types H5, H5N1, H5N2, H7 et H7N6) en Afrique subsaharienne par date de survenue (1 octobre 2023 à ce jour)
Note: Carte A présente les événements confirmés d’IAHP observés depuis le 1er octobre jusqu’au 11 juillet 2024 (vague actuelle). La carte B présente les événements confirmés d’IAHP observes du 1 octobre 2022 a 30 septembre 2023 (vague précédente).
Tableau 1. Evènements d’influenza aviaire hautement pathogène déclarés chez les animaux depuis le 1 octobre 2023 (i.e. vague actuelle)
Virus | Pays (régions administratives affectées) | Date du dernier évènement observé | Nombre d’évènements depuis la dernière mise à jour | Nombre d’évènements depuis le 1er octobre 2023 | Espèces affectées au cours des derniers évènements |
---|---|---|---|---|---|
H5 |
Afrique du Sud |
20/04/2024 |
0 |
24 |
Autruches commerciales, Volailles, Manchot du Cap, Sterne Huppée |
H5N1 |
Nigéria |
27/02/2024 |
0 |
3 |
Volailles, Paons en captivité |
Burkina Faso |
26/03/2024 |
0 |
2 |
Volailles domestiques |
|
Niger |
13/05/2024 |
0 |
2 |
Volailles domestiques, Pintades |
|
Gabon |
03/05/2024 |
1 |
1 |
Volailles domestiques |
|
H7N6 |
Mozambique |
29/09/2023 |
0 |
1 |
Poules pondeuses |
Afrique du Sud |
18/12/2023 |
1 |
67 |
Volailles et autres oiseaux domestiques |
Pour un résumé des événements d'IAHP H5N1, H5N6 et H5N8, signalés dans les pays d'Afrique subsaharienne lors des vagues précédentes (c'est-à-dire avant le 1er octobre 2023), veuillez contacter EMPRES-Animal Health.
Abolnik, C., Roberts, L. C., Strydom, C., Snyman, A., & Roberts, D. G. 2024. Outbreaks of H5N1 High Pathogenicity Avian Influenza in South Africa in 2023 Were Caused by Two Distinct Sub-Genotypes of Clade 2.3.4.4b Viruses. [Les épidémies de grippe aviaire hautement pathogène H5N1, en Afrique du Sud en 2023, ont été causées par deux sous-génotypes distincts des virus de clade 2.3.4.4b]. Viruses, 16(6):896. reference En 2023, l'Afrique du Sud a connu des cas sporadiques de grippe aviaire hautement pathogène (HPAI) H5N1 clade 2.3.4.4b chez les oiseaux de mer côtiers et la volaille. La surveillance environnementale a révélé la circulation de divers sous-types de grippe aviaire, le H5Nx étant le plus courant. Le séquençage du génome des cas de H5N1 HPAI a indiqué que seuls deux des quinze sous-génotypes de 2021-2022 persistaient en 2023. Le sous-génotype SA13 était limité aux oiseaux de mer côtiers, montrant des mutations accélérées de la protéine neuraminidase. Le SA15 était responsable des épidémies chez les poulets, avec des incidents distincts dans les provinces du Cap occidental et du KwaZulu-Natal, suggérant les oiseaux sauvages comme source. Les virus SA15 présentaient une troncation du gène PB1-F2 et un nouvel isoforme PA-X dans les cas du Cap occidental. Les virus H5N1 clade 2.3.4.4b sud-africains montraient moins de marqueurs de virulence par rapport aux souches européennes, ce qui pourrait expliquer l'absence de transmission aux mammifères.
Adesola, R.O., Onoja, B.A., Adamu, A.M., Agbaje, S.T., Abdulazeez, M.D., Akinsulie, O.C., Bakre, A. & Adegboye, O.A. 2024. Molecular epidemiology and genetic evolution of avian influenza H5N1 subtype in Nigeria, 2006 to 2021. [Épidémiologie moléculaire et évolution génétique du sous-type H5N1 de la grippe aviaire au Nigeria, de 2006 à 2021]. Virus Genes, 2024 Jun 19. reference En 2006, le Nigeria a connu l'un des premiers foyers du virus de la grippe aviaire hautement pathogène (GAHP) H5N1, qui s'est ensuite propagé à d'autres pays africains. En 2023, 18 pays ont signalé des foyers de H5N1 chez les volailles, avec des cas humains en Égypte, au Nigeria et à Djibouti. Les données sur l'épidémiologie moléculaire du GAHP H5N1 au Nigeria sont limitées. Nous avons examiné l'épidémiologie moléculaire et l'évolution génétique du virus de 2006 à 2021, analysant sa tendance et sa distribution géographique à travers le Nigeria. L'histoire évolutive de 61 génomes complets provenant de 13 pays a été comparée avec les séquences des épidémies nigérianes. L'analyse phylogénétique avec MEGA 11 a révélé une proximité entre les séquences nigérianes et celles d'autres pays africains. La classification des clades a identifié le clade H5N1 2.2 en 2006, avec l'apparition ultérieure des clades 2.3.2, 2.3.2.1f et 2.3.4.4b d'ici 2021. Ces résultats soulignent l'importance de la surveillance génomique pour suivre les variations antigéniques et les changements de clade, garantissant la santé des humains et des animaux.
Mercy, K., Salyer, S.J., Mankga, C., Hedberg, C., Zondo, P., Kebede, Y. 2024. Establishing an early warning event management system at Africa CDC. [Mise en place d'un système de gestion des événements d'alerte précoce au sein de CDC Afrique]. PLOS Digit Health, 3(7):e0000546. reference L'Afrique est un point chaud pour l'émergence et la réémergence des maladies, nécessitant des systèmes d'alerte précoce tels que la surveillance basée sur les événements (SBE). En 2020, les Centres africains de contrôle et de prévention des maladies (Africa CDC) ont développé un système de gestion des événements (EMS) en utilisant le logiciel libre et open-source District Health Information Software (DHIS2) pour gérer ces événements. L'EMS, créé par un processus collaboratif, a été lancé en juin 2020. D'ici décembre 2022, 416 événements ont été capturés et plus de 140 rapports hebdomadaires, dont 19 spécifiques à la COVID-19, ont été générés pour informer les efforts de réponse. La plupart des événements ont touché les humains (69%), avec des niveaux de risque modérés (50%) à élevés (29%), reflétant des éclosions de maladies émergentes et endémiques. La grippe aviaire hautement pathogène H5N1 a été l'événement animal le plus détecté, tandis que les tempêtes et les inondations étaient des événements environnementaux fréquents. La complétude et la rapidité des données se sont améliorées, ce qui a conduit quatre pays africains à adopter l'EMS en 2022 et deux de plus en 2023. Cela met en lumière comment la technologie numérique et des plateformes comme DHIS2 peuvent améliorer les flux de travail d'alerte précoce et de SBE.
Oguzie, J.U., Marushchak, L.V., Shittu, I., Lednicky, J.A., Miller, A.L., Hao, H., Nelson, M.I. & Gray, G.C. 2024. Avian Influenza A(H5N1) Virus among Dairy Cattle, Texas, USA. [Virus de la grippe aviaire A (H5N1) chez les bovins laitiers, Texas, États-Unis]. Emerging Infectious Diseases, 30(7). reference Pendant les mois de mars et avril 2024, des spécimens de bovins laitiers provenant d'une seule ferme au Texas, États-Unis, ont été étudiés à l'aide de techniques de détection de pathogènes multiples, y compris des méthodes moléculaires, des cultures cellulaires et le séquençage de nouvelle génération. L'analyse a révélé que les souches du virus de la grippe aviaire hautement pathogène A(H5N1) du clade 2.3.4.4b étaient la seule cause de cette épizootie.
Shalaby, S., Awadin, W., Manzoor, R. et al. 2024. Pathological and phylogenetic characteristics of fowl AOAV-1 and H5 isolated from naturally infected Meleagris Gallopavo. [Caractéristiques pathologiques et phylogénétiques de l'AOAV-1 et du H5 de la volaille isolés chez des Meleagris gallopavo naturellement infectés]. BMC Veterinary Research, 20:216. [reference]
Bedair, N.M., Sakr, M.A., Mourad, A., Eissa, N., Mostafa, A. & Khamiss, O. 2024. Molecular characterization of the whole genome of H9N2 avian influenza virus isolated from Egyptian poultry farms. [Caractérisation moléculaire du génome complet du virus de la grippe aviaire H9N2 isolé dans des fermes avicoles égyptiennes]. Archives of Virology, 169(5):99. [reference]
Kutkat, O., Gomaa, M., Aboulhoda, B.E., Moatasim, Y., El Taweel, A., Kamel, M.N., El Sayes, M., et al. 2024. Genetic and virological characteristics of a reassortant avian influenza A H6N1 virus isolated from wild birds at a live-bird market in Egypt. [Caractéristiques génétiques et virologiques d'un virus de la grippe aviaire A H6N1 réassortant isolé chez des oiseaux sauvages sur un marché aux oiseaux vivants en Égypte]. Archives of Virology, 169(5):95. [reference]
Olawuyi, K., Orole, O., Meseko, C., Monne, I., Shittu, I., Bianca, Z., Fusaro, A., et al. 2024. Detection of clade 2.3.4.4 highly pathogenic avian influenza H5 viruses in healthy wild birds in the Hadeji-Nguru wetland, Nigeria 2022. [Détection de virus de la grippe aviaire hautement pathogène H5 du clade 2.3.4.4 chez des oiseaux sauvages en bonne santé dans le marais de Hadeji-Nguru, au Nigéria en 2022]. Influenza Other Respiratory Viruses, 18(2):e13254. [reference]
Olawuyi, K., Orole, O., Meseko, C., Monne, I., Shittu, I., Bianca, Z., Fusaro, A., et al. 2024. The Public Health Importance and Management of Infectious Poultry Diseases in Smallholder Systems in Africa. Influenza Other Respir Viruses, 18(2):e13254. [reference]
Monjane, I. V. A., Djedje, H., Tamele, E., Nhabomba, V., Tivane, A. R., Massicame, Z. E., Arone, D. M., Pastori, A., Bortolami, A., Monne, I., Woma, T., Lamien, C. E. & Dundon, W. G. 2024. H7N6 highly pathogenic avian influenza in Mozambique, 2023. Emerging Microbes & Infections, 13, (1). [reference]
Sanogo, I.N., Guinat, C., Dellicour, S., Diakité, M.A., Niang, M., Koita, O.A., Camus, C. & Ducatez, M. 2024. Genetic insights of H9N2 avian influenza viruses circulating in Mali and phylogeographic patterns in Northern and Western Africa. Virus Evolution, 10(1):veae011. [reference]
Glazunova, A., Krasnova, E., Bespalova, T., Sevskikh, T., Lunina, D., Titov, I., Sindryakova, I. & Blokhin, A. 2024. A highly pathogenic avian influenza virus H5N1 clade 2.3.4.4 detected in Samara Oblast, Russian Federation. Front Vet Sci, 11 – 2024. [reference]
Grace, D., Knight-Jones, T. J., Melaku, A., Alders, R. & Jemberu, W. T. 2024. The Public Health Importance and Management of Infectious Poultry Diseases in Smallholder Systems in Africa. Foods, 13(3), 411. [reference]
Kenmoe, S., Takuissu, G.R., Ebogo-Belobo, J.T., Kengne-Ndé, C., Mbaga, D.S., Bowo-Ngandji, A. & Ondigui Ndzie, J.L. et al. 2024. A systematic review of influenza virus in water environments across human, poultry, and wild bird habitats. Water Res X, 22:100210. [reference]
Roberts, L.C., Abernethy, D., Roberts, D.G., Ludynia, K., O'Kennedy, M.M., Abolnik, C. 2023. Vaccination of African penguins (Spheniscus demersus) against high-pathogenicity avian influenza.Vet Rec, e3616. [reference]
Abolnik, C. 2023. Spillover of an endemic avian Influenza H6N2 chicken lineage to ostriches and reassortment with clade 2.3.4.4b H5N1 high pathogenicity viruses in chickens. Vet Res Commun. [reference]
Fagrach, A., Arbani, O., Karroute, O., El-Ftouhy, F.Z., Kichou, F., Bouslikhane, M., Fellahi, S. 2023. Prevalence of major infectious diseases in backyard chickens from rural markets in Morocco. Vet World, 16(9):1897-1906. [reference]
Meseko, C., Ameji, N.O., Kumar, B. & Culhane, M. 2023. Rational approach to vaccination against highly pathogenic avian influenza in Nigeria: a scientific perspective and global best practice. Arch Virol, 168(10):263. [reference]
Agha, A.S.K., Benlashehr, I., Naffati, K.M., Bshina, S.A. & Khashkhosha, A.A. 2023. Correlation of avian influenzaH9N2 with high mortality in broiler flocks in the southwest of Tripoli, Libya. Open Vet J, 13(6):715-722. [reference].
Bongono, E.F., Kaba, L., Camara, A., Touré, A., Ngoma, M.P., Yanogo, P.K., Kanyala, E. & SOW A. 2023. Évaluation de la biosécurité et facteurs associés à l'influenza aviaire dans les fermes avicoles de Coyah, Guinée, 2019-2020. Med Trop Sante Int. 2023 3(2):25. [reference].
Isibor, P.O., Onwaeze, O.O., Kayode-Edwards, I.I., Agbontaen, D.O., Ifebem-Ezima, A.M., Bilewu, O., Onuselogu, C., Akinniyi, A.P., Obafemi, Y.D. & Oniha, M.I. 2023. Investigating and combatting the key drivers of viral zoonoses in Africa: an analysis of eight epidemics. Braz J Biol, 84:e270857. [reference]
Lebarbenchon, C., Boucher, S., Feare, C., Dietrich, M., Larose, C., Humeau, L., Le Corre, M. & Jaeger, A. 2023. Migratory patterns of two major influenza virus host species on tropical islands. R Soc Open Sci, 10(10):230600. [reference]
Jbenyeni, A., Croville, G., Cazaban, C. & Guérin, J.L. 2023. Predominance of low pathogenic avian influenza virus H9N2 in the respiratory co-infections in broilers in Tunisia: a longitudinal field study, 2018-2020. Vet Res, 54(1):88. [reference]
Alhaji, N.B., Adeiza, A.M., Godwin, E.A., Haruna, A.E., Aliyu, M.B. & Odetokun, I.A. 2023. An assessment of the highly pathogenic avian influenza resurgence at human-poultry-environment interface in North-central Nigeria: Sociocultural determinants and One Health implications. One health, 16:100574 [reference]
Miller, LmNm, Elmselati, H., Fogarty, A.S., Farhat, M.E., Standley, C.J., Abuabaid, H.M. & Zorgani, A. 2023. Using One Health assessments to leverage endemic disease frameworks for emerging zoonotic disease threats in Libya. PLOS Glob Public Health, 3(7):e0002005 [reference]
Abolnik, C., Phiri, T., Peyrot, B., de Beer, R., Snyman, A., Roberts, D., Ludynia, K. et al. 2023. The Molecular Epidemiology of Clade 2.3.4.4B H5N1 High Pathogenicity Avian Influenza in Southern Africa, 2021–2022. Viruses, 15(6):1383. [reference]
Meseko, C., Milani, A., Inuwa, B., Chinyere, C., Shittu, I., Ahmed, J., Giussani, E. et al. 2023. The Evolution of Highly Pathogenic Avian Influenza A (H5) in Poultry in Nigeria, 2021–2022. Viruses,15:1387. [reference]
Nma Bida Alhaji, Abdulrahman Musa Adeiza, Enid Abutu Godwin, Aliyu Evuti Haruna, Mohammed Baba Aliyu and Ismail Ayoade Odetokun. 2023. An assessment of the highly pathogenic avian influenza resurgence at human-poultry-environment interface in North-central Nigeria: Sociocultural determinants and One Health implications. One Health, 16:100574. [reference]
Lo, F.T., Zecchin, B., Diallo, A.A., Racky, O., Tassoni, L., Diop, A., Diouf, M., Diouf, M., Samb, Y.N., Pastori, A., Gobbo, F., Ellero, F., Diop, M., Lo, M.M., Diouf, M.N., Fall, M., Ndiaye, A.A., Gaye, A.M., Badiane, M., Lo, M., Youm, B.N., Ndao, I., Niaga, M., Terregino, C., Diop, B., Ndiaye, Y., Angot, A., Seck, I., Niang, M., Soumare, B., Fusaro, A. & Monne, I. 2022. Intercontinental Spread of Eurasian Highly Pathogenic Avian Influenza A(H5N1) to Senegal. Emerg Infect Dis. 28(1):234-237. [reference]
Panzarin, V., Marciano, S., Fortin, A., Brian, I., D'Amico, V., Gobbo, F., Bonfante, F., Palumbo, E., Sakoda, Y., Le, K.T., Chum D.H., Shittu, I., Meseko, C., Haido, A.M., Odoom, T., Diouf, M.N., Djegui, F., Steensels, M., Terregino, C. & Monne, I. 2022. Redesign and Validation of a Real-Time RT-PCR to Improve Surveillance for Avian Influenza Viruses of the H9 Subtype. Viruses. 14(6):1263. [reference]
Benin:
Burkina Faso:
Côte d’Ivoire:
Éthiopie:
Gambie:
Gabon:
Ghana:
Kenya:
Liberia:
Mali:
Niger:
Nigeria:
Sierra Leone:
Soudan du Sud:
ECTAD AES
ECTAD AOC
Burkina Faso:
Ethiopia:
Gabon:
Ghana:
Liberia:
Mali:
Niger:
Nigeria:
Senegal:
Sierra Leone:
Les informations fournies dans le présent document sont à jour à la date de publication. Les informations ajoutées ou modifiées, depuis la dernière mise à jour de la situation de l'IAHP en Afrique subsaharienne, apparaissent en orange. Pour les cas de volailles dont les dates d’apparition sont inconnues, les dates de déclaration ont été utilisées à la place. La FAO compile les informations communiquées par les agents sur le terrain dans les pays touchés, par les bureaux régionaux et par l'Organisation mondiale de la santé animale [WOAH], ainsi que des articles scientifiques évalués par des pairs. La FAO s'efforce d'assurer, mais ne garantit pas l'exactitude, l'exhaustivité ou l'authenticité des informations. Les limites et les noms indiqués, ainsi que les désignations utilisées sur ces cartes, n'impliquent l'expression d'aucune opinion de la part de la FAO concernant le statut juridique de tout pays, territoire, ville ou zone ou de ses autorités, ou concernant la délimitation de ses frontières et limites. Les lignes pointillées sur les cartes représentent des frontières approximatives pour lesquelles il n’y a peut-être pas encore d’accord total.
Pour un bilan des cas d’IAHP H5N1, H5N6 et H5N8 déclarés par les pays d’Afrique subsaharienne avant la vague actuelle (i.e. avant le 1er octobre 2021), veuillez contacter EMPRES-Animal Health