Como red juvenil autodirigida, el El Grupo de Trabajo de la Juventud Mediterránea (MYTF) tiene una estructura participativa que permite una participación y un compromiso significativos de los jóvenes.  
 
El MYTF está estructurado y dirigido por el Consejo de Dirección, que lidera el trabajo y los esfuerzos del grupo de trabajo. La Junta Directiva es responsable del funcionamiento general del grupo de trabajo, coordinando todos los comités y actividades. El Consejo de Dirección se compone de las siguientes funciones: 

• Coordinador del MYFT;
• Coordinador adjunto del MYFT;
• Coordinador de comunicación;
• Coordinador de colaboraciones;
• Coordinador de eventos;
• Coordinador financiero, y  
• Coordinador científico.

Los comités promueven la participación de los jóvenes. Cada comité tiene un enfoque específico y está guiado y supervisado por un coordinador para facilitar el trabajo.